La Yamaha YZR 500 del año 2000 había sufrido numerosos cambios, estas modificaciones se hicieron para mejorar las sensaciones del piloto y la manejabilidad, lo que animaba al piloto a acelerar más y antes. El cambio más grande en la apariencia del modelo del 2001 fue la carrocería de fibra de carbono, que se diseñó para dar una mayor estabilidad a velocidades mas altas. Los dos pilotos de la marca Yamaha eran Max Biaggi y Carlos Checa.